Конфигурация — набор метаданных, реализованных на базе Метаплатформы, позволяющий автоматизировать бизнес-процессы в различных сферах деятельности. Например, конфигурация МП Медицина позволяет автоматизировать клинику или сеть клиник. Эта конфигурация содержит в себе метаданные  о врачах, пациентах, базовых процессах, происходящих в клинике (запись пациента на прием, алгоритмы договорной работы и оплаты счетов, ведение протоколов осмотров и так далее).

Конфигурация не может работать отдельно от метаплатформы. Не зависимо от специализации конфигурации, для каждого ее пользователя необходима лицензия на Метаплатформу.

Конфигурации могут быть разработаны как ООО Метаплатформа, так и одним из партнеров.

Конфигурации, представленные в каталоге являются базовыми для своего направления. В случае, если бизнес-процесс у заказчика отличается от базового, для него может быть произведена доработка конфигурации. Эти доработки могут быть вынесены в отдельный модуль и сохранены в отдельную БД конфигураций заказчика. Т.е. все, что было сделано для заказчика поверх базовой онфигурации будет физически храниться отдельно от базовой конфигурации и останется у заказчика. При этом базовая конфигурация по прежнему остается в каталоге и может поставляться другим заказчикам.